Nama Yayasan terinspirasi dari salah satu ayat yang terdapat dalam al-Qur’an Surat al-Qalam ayat 1. Dalam Tafsir al-Jailani dijelaskan bahwa Nun adalah nama lain Nabi Muhammad SAW yang berarti al-Naib ‘an al-Haq (Wakil Kebenaran), al-Nazhir bi Nurillah (yang melihat dengan cahaya Allah), al-Naqiy ‘an Jami’ al-Radzail (yang bersih dari sifat-sifat buruk). Diharapkan nama yayasan “Nun” bisa menjadi motivasi bagi seluruh pengurus agar dalam menjalankan lembaga ini berupaya sekuat tenaga untuk mencapai ridha Allah.
